В следующем докладе профессора Сидоренко С.В. (Национальное агентство по клинической фармакологии, Москва) на тему: «Перспективы микробиологической диагностики инфекционных заболеваний» было отмечено, что в настоящее время традиционными микробиологическими методами культивируются только 0.1% - 1.0% бактерий. Перспективным методом диагностики является метагеномика — технология, позволяющая выявлять всю совокупность генов бактерий в определенной экологической нише. Характеристика микробных сообществ осуществляется по составу генов — геном; по иРНК — транскриптом; по спектру белков — протеом; по продуктам метаболизма — метаболом. Метагеномные исследования предстательной железы показали, что если традиционными методами культивируются 7 микроорганизмов, то метагеномными методами выявлены 24 микроорганизма. При метагеномном исследовании простаты у больных с ДГПЖ или раком простаты, или хроническим простатитом выделено 52 микрорганизма разлисных семейств, наибjлее постоянными были Actinomyces sp, Corinebacterium sp, Escherichia sp, Pseudomonas sp, Streptococcus sp. Интересные данные ПЦР диагностики возбудителей инфекций, передаваемых половым путем (ИППП) в разных отделах простаты. Не выявлено диагностически значимой роли хламидий, трихомонад и вирусов: HPV,CMV,EBV, XMRV в 200 образцах простаты. Методом амплификации нуклеиновых кислот бактерии с неясной этиологической значимостью определены гарднереллы и микоплазмы. Однако, докладчик отметил, что разработка молекулярных методов детекции новых механизмов устойчивости неизбежно отстает от их появления и распространения и новый механизм будет обнаружен только тогда когда появятся массовые случаи неудач лечения. Перспективным методом является идентификация бактерий из биологического образца-секвенирование, масс-спектрометрия — идентификация на основании белковых спектров на основе Matrix-assisted laser desorption ionization—time-of-flight (MALDI-TOF), времяпролетная масс-спектрометрия с лазерной десорбцией / ионизацией в матрице — значительно уменьшает время идентификации микроорганизмов, однако не решает вопрос их клинической значимости. Необходимо промышленное производство тест-систем для оценки антибиотикочувствительности, основанных на методе серийных разведений и изучение кинетики роста бактерий.